遙か太古より、三女神の御座として栄えた『聖地トレセン』。
しかし今やかの地は、結託して三女神を負かしたウマ娘たちによって支配されていた。
シンボリルドルフ・イナリワン・アグネスタキオン・エアグルーヴがそれぞれ率いる4つのチームによる相互不干渉の関係は、シンボリルドルフの不穏な行動を受けた他の3チームが挑戦状を叩きつけたことにより瓦解する。

四方を敵に囲まれながらも、シンボリルドルフは己が勝利を疑わない。
かつて三女神と争ったアオハル戦役において、実質的な勝利をもたらしたとされる秘匿部隊――『疾黒走隊』が手駒にあるからだ。
戦乱の英雄と目されながらも歴史の闇に葬られた部隊、それを率いる主人公・ライスシャワー。
再びの戦乱を舞台に、彼女の野望が飛翔する――！