かつて、戦争があった
アースノイドとスペースノイドの確執が産んだ悲しき戦争。その結果は、両者に甚大な被害をもたらしての痛み分けという結果に終わった
(中略)
戦後約15年後、荒廃した地球で一人逞しく生きていた戦災孤児のトレーナーは、ある日とある少女の救出依頼を受ける
少女の名はドーベル。神秘的な雰囲気を持つ不思議な少女だった
救出作戦を成功させ依頼主に引き渡す際、ドーベルの異様な雰囲気を察したトレーナーは依頼を蹴ってドーベルと共に逃走。実はドーベルは「ニュータイプ」と呼ばれる新ウマ娘だったのだ
追手から逃げる最中、トレーナーは旧トレセン学園の敷地内に逃げ込む。そこには戦争の遺品、「ブルボン」が眠っていた
こうして、トレーナーは愛するドーベルを守るため、ブルボンXを駆ることになるのだった